Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms