Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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Rtf1A2AQ19 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Rtf1A2AQ19 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtf1A2AQ19 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Rtf1A2AQ19 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms