Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms