Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdl2A2AGA4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms