Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frmpd4A2AFR3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms