Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myom3A2ABU4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myom3A2ABU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms