Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smurf2A2A5Z6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smurf2A2A5Z6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms