Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms