Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms