Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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