Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv5A0A0B4J1G9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv5A0A0B4J1G9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv5A0A0B4J1G9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Trbv5A0A0B4J1G9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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