Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms