Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms