Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAM2Q15035 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAM2Q15035 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms