Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRCP08575 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPRCP08575 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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PTPRCP08575 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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PTPRCP08575 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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PTPRCP08575 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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PTPRCP08575 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRCP08575 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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