Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms