Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms