Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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