Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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VAMP3Q15836 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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VAMP3Q15836 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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VAMP3Q15836 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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VAMP3Q15836 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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VAMP3Q15836 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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VAMP3Q15836 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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