Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL19A1Q14993 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms