Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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