Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CXCL3P19876 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms