Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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LINC00587B1AMM8 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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LINC00587B1AMM8 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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LINC00587B1AMM8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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LINC00587B1AMM8 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LINC00587B1AMM8 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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