Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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USP18Q9UMW8 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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