Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRIM28Q13263 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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