Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP35Q9P2H5 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms