Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL1Q13616 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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