Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SREBF2Q12772 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SREBF2Q12772 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms