Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SS18Q15532 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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