Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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