Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
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PTPRDP23468 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPRDP23468 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPRDP23468 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPRDP23468 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPRDP23468 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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