Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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