Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms