Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CUL4BQ13620 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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