Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TRHP20396 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TRHP20396 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC012513.3-201ENST00000623250 2116 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TRHP20396 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRHP20396 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TRHP20396 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TRHP20396 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms