Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TDP1Q9NUW8 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TDP1Q9NUW8 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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