Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DTX3Q8N9I9 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms