Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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HMGN3Q15651 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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HMGN3Q15651 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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HMGN3Q15651 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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HMGN3Q15651 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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