Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms