Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RFXAPO00287 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RFXAPO00287 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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