Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms