Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Homer1Q9Z2Y3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms