Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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CcniQ9Z2V9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcniQ9Z2V9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CcniQ9Z2V9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CcniQ9Z2V9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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