Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Hdac6Q9Z2V5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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Hdac6Q9Z2V5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Hdac6Q9Z2V5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Hdac6Q9Z2V5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac6Q9Z2V5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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