Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tulp1Q9Z273 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms