Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip6Q9Z1Y4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms