Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms