Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms