Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne6Q9Z140 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms