Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NgfrQ9Z0W1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms